Kebomlati adalah merupakan penggabungan antara dua desa yaitu Keboan dan Mlaten. Dinamakan Keboan konon ceritanya karena masyarakat desa tersebut banyak memelihara "KEBO" (Jawa, Kerbau). Dan satu desa lagi dinakan Mlaten karena di desa tersebut banyak sekali ditumbuhi bunga melati.

Sewaktu masih bernama Keboan desa ini dipimpin oleh Petinggi (Kepala Desa) bernama SARIYO dengan "Carik" (Sekdes) SAMINGUN. Sedangkan desa Mlaten pada saat itu dipimpin oleh Petinggi (Kepala desa) bernama HARUN dan carik (sekdes) bernama TRUBUS. Kedua pimpinan ini memimpin hingga tahun 1925.

          Pada tahun itu juga kedua desa ini melebur diri menjadi satu dengan nama "KEBOANMLATEN" lama-kelamaan menjadi KEBOMLATI. Awal mula kedua desa ini menjadi satu dikarenakan desa Mlaten wilayahnya habis terkena erosi bengawan solo. Sehingga penduduknya banyak yang pindah lokasi sehingga dekat dengan Keboan. Hingga saat ini Desa Mlaten hampir habis terkikis air, dan sekarang banyak penduduk yang menempati tanah kas desa.

         Ketika bergabung menjadi satu desa yakni Keboanmlaten pada tahun 1925 desa ini dipimpin Petinggi bernama SADIRAN dan carik bernama TAMIRAN  dengan gelar SURO PRAWIRO. Petinggi SADIRAN menjabat selama 17 tahun kemudian digantikan oleh petinggi KASIRAN dengan gelar TRUNO KARSO pada tahun 1942. kepemimpinan Petinggi KASIRAN berakhir pada tahun 1971 diganti oleh Petinggi SUMADI (cucu menantu petinggi Sadiran) , dan Carik SURO PRAWIRO meninggal dunia pada tahun 1989 dan digantikan Pjs. KASNAJI. Selang lebih kurang 19 tahun menjadi petinggi, kepemimpinan petinggi SUMADI berakhir digantikan oleh Kepala Desa DARMADI dan Sekdes MAJURI pada tahun 1990. Dan berakhir setelah delapan tahun dan digantikan oleh Kepala Desa BAMBANG WIANTO (Anak petinggi SUMADI cicit dari petinggi SADIRAN) dan Sekdes MAJURI (cucu Petinggi KASIRAN).

 

DAFTAR NAMA KEPALA DESA KEBOMLATI

NO	NAMA KEPALA DESA	MASA JABATAN	NAMA SEKDES
1	SADIRAN	TAHUN 1925 – 1942	TAMIRAN (SURO PRAWIRO
2	KASIRAN (TRUNO KARSO)	TAHUN 1942 – 1971	TAMIRAN (SURO PRAWIRO
3	SUMADI	TAHUN 1971 – 1990	Pjs. KASNAJI
4	DARMADI	TAHUN 1990 – 1998	MAJURI
5	Pjs. MUNTHALIP	TAHUN 1998 – 1999	MAJURI
6	BAMBANG WIANTO	TAHUN 1999 – 2007	MAJURI
7	Pjs. KASNAJI	TAHUN 2007	MAJURI
8	PATONI	TAHUN 2007 – 2013	MAJURI
9	MUNTALIP	TAHUN 2013 – 2018	MAJURI
10	Pj. SULISTYO	TAHUN 2018	MAJURI
11	Pj. SUGENG WINOTO	TAHUN 2019	Plt. MUDHAKIR
12	H. MOENIDJAN	TAHUN 2019 – SEKARANG	KUSNANTORO, S.Pd